Flügger aktiekapital er opdelt i A- og B-aktier. A-aktierne har ti stemmer pr. aktie à 20 DKK, og B-aktierne har en stemme pr. aktie à 20 DKK.
Det er kun Flügger B-aktier, som er noteret på NASDAQ OMX Copenhagen A/S under fondskoden DK0010218189 med kortnavn FLUG B. Market maker på aktien er Danske Bank.
Ultimo regnskabsåret 2024/2025 var der registreret 1.759 aktionærer i selskabets ejerbog. Selskabets beholdning af egne aktier udgjorde 0,7 % af aktiekapitalen. De er stemmeløse iflg. Selskabsloven og værdisat til 0 DKK.